Участие чекистов подняло на более качественный уровень боевую деятельность партизанских формирований.
Подготовка к возможной оккупации территории орловских земель началась в первые месяцы войны. В населённых пунктах формировались истребительные батальоны, для которых создавались базы в лесных массивах области. В августе 1941 года они были подчинены 4-му отделу УНКВД по Орловской области под руководством ст. лейтенанта госбезопасности Черкасова Василия Афанасьевича. По мере захвата территории противником в августе-октябре 1941 года истребительные батальоны трансформировались в партизанские отряды.
В августе 1941 года создана орловская спецшкола - «школа пожарных» по подготовке диверсантов-разведчиков, инструкторов-подрывников для партизанской и подпольной деятельности. Готовили курсантов сотрудники Управления НКВД по Орловской области.
Перед 4-ми отделами УНКВД ставились следующие задачи: повседневный контроль за формированием истребительных батальонов, партизанских отрядов и диверсионных групп, руководство их боевой деятельностью; налаживание связи с истребительными батальонами, перешедшими на положение партизанских отрядов, а также с существующими партизанскими отрядами и диверсионными группами, находящимися в тылу противника; организация агентурной и войсковой разведки районов вероятных действий партизанских отрядов и диверсионных групп; разведка тыла противника и мест возможной переправы партизанских отрядов, обеспечение партизанских формирований оружием и боеприпасами для ведения боевых действий, а также продовольствием, одеждой и другим снаряжением.
Партизанские отряды и группы формировались из числа проверенных, преданных нашей Родине людей, главным образом членов и кандидатов партии. В составе партизанских отрядов и групп было оставлено 235 человек работников НКВД (в том числе - чекистов, милиции, военизированной пожарной охраны), значительная часть которых возглавила партизанские формирования. Все переброски партизанских формирований в тыл противника осуществлялись при непосредственном участии чекистов. С сентября 1941 года по июнь 1942 года было сформировано на базе 4-го отдела и переброшено через линию фронта 300 диверсионно-разведывательных групп численностью 800 человек.
Летом 1942 года в зоне деятельности партизанских отрядов юго-западных и северо-западных районов Орловской области, 4-м отделом из числа чекистов, действовавших в партизанских отрядах на разных должностях, были сформированы два оперативно-чекистских отдела с отделениями при каждой партизанской бригаде. В этом чекистском аппарате к 1943 году было занято 62 человека. Из них 48 обслуживали в южной части Брянских лесов до 10 000 партизан и около 150 000 мирных жителей, остальные в северной части Брянских лесов обслуживали около 3000 партизан.
Во многих партизанских соединениях и отрядах командирами были орловские чекисты:
- Емлютин Дмитрий Васильевич - Герой Советского Союза, младший лейтенант ГБ, начальник Суражского РО НКВД, командир объединённых партизанских бригад;
- Золотухин Василий Иванович - младший лейтенант ГБ, оперативный работник Людиновского РО НКВД, командир партизанского отряда;
- Сентюрин Николай Михайлович - лейтенант ГБ, с июля 1941 года - инструктор разведшколы по подготовке партизанских кадров, заведующий партизанской базой, с сентября 1941 года по июнь 1942 года - командир партизанского отряда в Дятьковском районе;
- Мартынов Петр Михайлович - сержант ГБ, начальник Дубровского РО НКВД, командир Рогнединской партизанской бригады;
- Мятишкин Петр Тимофеевич - лейтенант ГБ, начальник Хвастовичского РО НКВД, командир партизанского отряда;
- Месропов Арамаис Андреевич - начальник Карачевского РО НКВД, командир партизанского отряда.
Возглавлял Орловский штаб партизанского движения первый секретарь обкома, старший майор госбезопасности (генерал-майор) Матвеев Александр Павлович.
В связи с организацией в 1942 году Центрального штаба партизанского движения Управлением НКВД были переданы в его распоряжение многочисленные отряды и группы. Вместе с тем, следовало из директивы НКВД СССР от 13 июля 1942 года, штабам партизанского движения не подлежали передаче разведывательно-диверсионные группы специального назначения, действовавшие в тылах противника, разведывательная агентура, курьеры и связники, резиденты в немецком тылу, а также переписка по партизанским формированиям (сводки, донесения, доклады, радиограммы и т.д.).
Историк-краевед Геннадий Афанасьев